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<NBS8205> FastCut SmaI

欄目:NoninBio
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識(shí)別位點(diǎn):
CCCGGG
5'...C C C ↓ G G G...3'
3'...G G G ↑ C C C...5'

異裂酶:Cfr9I, TspMI, XmaI
注:同裂酶對(duì)于不同的甲基化修飾也許具有不同敏感性。

 

FastCut SmaI 

產(chǎn)品編號(hào)

產(chǎn)品名稱(chēng)

包裝規(guī)格

價(jià)格

NBS8205

FastCut SmaI

100 rxns

298

 

產(chǎn)品簡(jiǎn)介:

FastCut快速內(nèi)切酶是一系列經(jīng)過(guò)基因工程重組的快速限制性?xún)?nèi)切酶,適用于質(zhì)粒 DNA、PCR 產(chǎn)物或基因組 DNA 等的快速酶切。所有 FastCut快速內(nèi)切酶在通用的 FastCut 或 FastCut Color Buffer 中都具有優(yōu)良的活性,能夠在 5~15 分鐘內(nèi)完成酶切。此外去磷酸化、連接試劑在FastCut Buffer中均具有100% 活性,支持一管化反應(yīng),提升“酶切 - 修飾 - 連接”的體驗(yàn)。

FastCut Color Buffer包括紅色和黃色示蹤染料,可將產(chǎn)物直接用于凝膠電泳。FastCut Color Buffer 的紅色染料與2500 bp 雙鏈DNA片段在 1% 瓊脂糖凝膠中遷移速率接近;黃色染料與10 bp雙鏈DNA片段在 1% 瓊脂糖凝膠中遷移速率接近。

識(shí)別位點(diǎn):

CCCGGG
5'...C C C ↓ G G G...3'
3'...G G G ↑ C C C...5'

異裂酶:Cfr9I, TspMI, XmaI

注:同裂酶對(duì)于不同的甲基化修飾也許具有不同敏感性。

 

產(chǎn)品組成:

組分

規(guī)格

FastCut SmaI

100 μl

10× FastCut Buffer

1 ml

10× FastCut Color Buffer

1 ml


保存條件

-20℃保存,2年有效。


建議反應(yīng)條件:

1× FastCut 緩沖液;

25℃溫育;

參照“DNA 快速酶切流程配制反應(yīng)體系。

 

失活條件:

80℃溫育20 min

 

功能活性檢測(cè):

25℃下,在20 μl通用FastCut反應(yīng)體系中,1 μl FastCut SmaI能夠在15 min內(nèi)完全消化1 μg λDNA (HindIII digest)。

 

超長(zhǎng)時(shí)間溫育檢測(cè):

25℃下,在20 μl通用FastCut反應(yīng)體系中,將1 μl FastCut SmaI與1 μg λDNA (HindIII digest)共同溫育3 h,未檢測(cè)到其他核酸酶污染或星號(hào)活性引起的底物非特異性降解。更長(zhǎng)時(shí)間酶切可能出現(xiàn)星號(hào)活性。

 

酶切-連接-再酶切檢測(cè):

25℃下,使用10倍酶量的FastCut SmaI消化DNA底物,回收酶切產(chǎn)物,在22℃下使用T4 DNA Ligase (Fast)可以將超過(guò)95%的酶切產(chǎn)物重新連接。將連接產(chǎn)物再次回收后,使用相同的內(nèi)切酶可以重新切開(kāi)約95%以上的連接產(chǎn)物。

 

非特異性?xún)?nèi)切酶活性檢測(cè):

25℃下,在20 μl通用FastCut反應(yīng)體系中將1 μl FastCut SmaI與 1 μg 超螺旋質(zhì)粒DNA共同溫育4 h后,使用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),少于10%的質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)變成缺刻或線(xiàn)性狀態(tài)。

 

藍(lán)白斑檢測(cè)

使用1 μl FastCut SmaI消化含有lacZα 基因且僅在該基因上具有1個(gè)酶切位點(diǎn)的特定載體。將酶切產(chǎn)物重新連接后轉(zhuǎn)化到大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞中,涂布在含有X-galIPTG和相應(yīng)抗生素的LB平板培養(yǎng)基上生長(zhǎng)。成功連接的β-半乳糖苷酶基因可以正確表達(dá),并生長(zhǎng)出藍(lán)色菌落;而因酶切末端降解等原因未能重新連接的產(chǎn)物將得到白色菌落。對(duì)于FastCut系列限制酶而言,白色菌落的比例應(yīng)當(dāng)小于1%

 

使用方法:

1. DNA快速酶切流程

在冰上按如下建議的加樣順序配制反應(yīng)體系:


質(zhì)粒DNA

PCR產(chǎn)物

基因組DNA

ddH2O

15μl

16μl

30μl

10× FastCut Buffer 10× FastCut Color Buffer

2μl

3μla

5μl

底物DNA

2μl (up to 1μg)

10μl (~0.2μg)

10μl (5μg)

FastCut SmaI

1μl

1μl

5μl

Total

20μl

30μl

50μl

a.本體系適用于經(jīng)過(guò)純化的PCR產(chǎn)物酶切。未純化的PCR產(chǎn)物具備一定的離子強(qiáng)度,10× FastCut Buffer 加入量可適當(dāng)減少至2 μl。但由于DNA聚合酶同時(shí)具有外切酶活性,會(huì)影響酶切產(chǎn)物,因此如下一步需進(jìn)行克隆等操作,建議酶切前對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化。

輕柔吸打或輕彈管壁以混勻(切勿渦旋),然后瞬時(shí)離心以收集掛壁液滴;

③ 25℃溫育15 min(質(zhì)粒),或15~30 minPCR產(chǎn)物),或30~60 min(基因組DNA); ④ 80℃溫育20 min即可使酶失活,停止反應(yīng)(可選);

如果使用FastCut Color Buffer進(jìn)行酶切反應(yīng),得到的產(chǎn)物可以直接進(jìn)行上樣電泳。

2. 雙酶切或多酶切

每種快速內(nèi)切酶的用量為1 μl,并根據(jù)需要適當(dāng)擴(kuò)大反應(yīng)體系;

所有快速內(nèi)切酶的體積總和不得超過(guò)總反應(yīng)體系的1/10

如果所用的幾種快速內(nèi)切酶的最適反應(yīng)溫度不同,應(yīng)先以最適溫度低的酶開(kāi)始酶切,再添加最適溫度較高的酶,在其最適反應(yīng)溫度下進(jìn)行酶切反應(yīng)。

3. 適用于質(zhì)粒的擴(kuò)大反應(yīng)體系

DNA

1μg

2μg

3μg

4μg

5μg

FastCut SmaI

1μl

2μl

3μl

4μl

5μl

10× FastCut Buffer

10×FastCut Color Buffer

2μl

2μl

3μl

4μl

5μl

Total

20μl

20 μl

30μl

40 μl

50 μl

注:如果總反應(yīng)體系大于20 μl,應(yīng)適當(dāng)增加溫育時(shí)間,盡量使用水浴、金屬浴或沙浴。

 

不同DNA中的酶切位點(diǎn)數(shù)量

λDNA

ΦX174

pBR322

pUC57

pUC18/19

SV40

M13mp18/19

Adeno2

3

0

0

1

1

0

1

12

 

甲基化修飾影響

Dam

Dcm

CpG

EcoKI

EcoBI

無(wú)影響

無(wú)影響

剪切受阻

無(wú)影響

無(wú)影響

 

在不同反應(yīng)緩沖液中的活性


FastCut

Buffer

Thermo Scientific

FastDigest Buffer

NEB

rCutSmart? Buffer

Takara

QuickCut? Buffer

活性

100%

100%

100%

100%

注:活性數(shù)據(jù)來(lái)自限制酶標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系下的檢測(cè)。

 

注意事項(xiàng):

為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。